В 1996 году состоялось подписание договора о шефских связях между экипажем корабля и Министерством Российской Федерации по атомной энергии. В октябре 2000 года подводному крейсеру присвоено почетное наименование «Дмитрий Донской».
После ремонта и модернизации на подводном крейсере эксплуатируются современные навигационные, ракетные и другие комплексы, его экипаж работает в тесном сотрудничестве с представителями судостроительной промышленности. Командует тяжелым атомным подводным ракетным крейсером стратегического назначения «Дмитрий Донской» капитан 2 ранга Олег Цыбин.